Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpraP18052 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpraP18052 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpraP18052 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpraP18052 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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