Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tph1P17532 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tph1P17532 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tph1P17532 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tph1P17532 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tph1P17532 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tph1P17532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tph1P17532 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms