Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30aP15533 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms