Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prf1P10820 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prf1P10820 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prf1P10820 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prf1P10820 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms