Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd7P0C872 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd7P0C872 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Jmjd7P0C872 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Jmjd7P0C872 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Jmjd7P0C872 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Jmjd7P0C872 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd7P0C872 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms