Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04944 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04944 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04944 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04944 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04944 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04944 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04944 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04944 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04944 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04944 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04944 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04944 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04944 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms