Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FosP01101 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FosP01101 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FosP01101 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FosP01101 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FosP01101 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FosP01101 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FosP01101 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FosP01101 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FosP01101 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FosP01101 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FosP01101 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FosP01101 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FosP01101 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FosP01101 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FosP01101 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FosP01101 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FosP01101 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FosP01101 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FosP01101 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FosP01101 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FosP01101 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FosP01101 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FosP01101 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FosP01101 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FosP01101 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FosP01101 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FosP01101 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FosP01101 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FosP01101 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FosP01101 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FosP01101 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FosP01101 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FosP01101 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms