Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl2O89104 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sypl2O89104 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl2O89104 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl2O89104 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl2O89104 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl2O89104 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sypl2O89104 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sypl2O89104 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sypl2O89104 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms