Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp2O88554 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Parp2O88554 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp2O88554 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp2O88554 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Parp2O88554 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp2O88554 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms