Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pja1O55176 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pja1O55176 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.4 ms