Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb10O35955 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms