Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chil3O35744 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chil3O35744 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chil3O35744 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chil3O35744 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms