Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac1O09106 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac1O09106 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms