Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckarO08786 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckarO08786 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckarO08786 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckarO08786 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckarO08786 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckarO08786 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckarO08786 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckarO08786 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckarO08786 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckarO08786 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckarO08786 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckarO08786 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckarO08786 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckarO08786 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CckarO08786 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms