Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8356J3QPD3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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