Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm21900J3QP38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm21900J3QP38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21900J3QP38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm21900J3QP38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21900J3QP38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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