Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd4b4J3QNS5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mfsd4b4J3QNS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms