Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21244J3QK38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21244J3QK38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms