Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c3J3QJW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms