Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP9

Scgb2a2, Secretoglobin, family 2A, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2a2J3KMP9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scgb2a2J3KMP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scgb2a2J3KMP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb2a2J3KMP9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb2a2J3KMP9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb2a2J3KMP9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Scgb2a2J3KMP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms