Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r194J3JS27 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms