Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vmn1r167G3UW71 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r167G3UW71 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Vmn1r167G3UW71 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Vmn1r167G3UW71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Vmn1r167G3UW71 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r167G3UW71 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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