Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28048F7BCN0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm28048F7BCN0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Gm28048F7BCN0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28048F7BCN0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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