Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp17lbE9Q9U0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp17lbE9Q9U0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms