Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UtrnE9Q6R7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UtrnE9Q6R7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UtrnE9Q6R7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UtrnE9Q6R7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms