Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r68E9Q0V3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r68E9Q0V3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms