Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3298E9PW80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3298E9PW80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3298E9PW80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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