Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms