Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AU019823E9PUQ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AU019823E9PUQ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms