Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm4491E0CX42 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm4491E0CX42 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm4491E0CX42 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm4491E0CX42 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm4491E0CX42 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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