Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18b1D3Z5L6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms