Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc13D3YV10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc13D3YV10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms