Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scn7aB1AYL1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scn7aB1AYL1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn7aB1AYL1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms