Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd60A2AMD2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd60A2AMD2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd60A2AMD2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd60A2AMD2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd60A2AMD2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd60A2AMD2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms