Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a3A2ACT7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms