Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ino80eA0A0U1RP99 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms