Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl3Q9Z2M6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.3 ms