Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VarsQ9Z1Q9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VarsQ9Z1Q9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms