Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shcbp1Q9Z179 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shcbp1Q9Z179 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms