Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf2Q9WTU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf2Q9WTU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf2Q9WTU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms