Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv2Q9WTR1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms