Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6cQ9WTM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms