Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Gpc1Q9QZF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Gpc1Q9QZF2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Gpc1Q9QZF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Gpc1Q9QZF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpc1Q9QZF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms