Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Six6Q9QZ28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms