Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11aQ9QYE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcl11aQ9QYE3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms