Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cml5Q9QXS8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cml5Q9QXS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms