Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tcf23Q9JLR5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf23Q9JLR5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf23Q9JLR5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms