Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmx1aQ9JKU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmx1aQ9JKU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms