Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpa33Q9JKA5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms