Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Riox1Q9JJF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Riox1Q9JJF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms